Compile C++ in UNIX - Linux

各位前輩好！
我剛剛碰Linux Server
老師丟了一堆東西給我
我在server上現在放了四個 Folder(A, B, C, D) 還有各執行檔(ext)
但是有段說明我不懂要如何做：
ext:
Combine W datat into one single file in the format of B
" Modify extparameter.txt to extract data from a region "???

一般情況下我都直接用下面指令：
$: ./ext

請問我要怎麼做到萃取我的資料從特定的資料夾中呢？
麻煩各位的指導了！
謝謝您！！

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