無法將SSD設為主硬碟，是因為存在舊系統? - 儲存設備

想要請問一下目前的電腦搭配是SSD+HDD，
SSD內有新安裝的WIN8.1，HDD內有舊的WIN8.1。
由於再購入SSD之前主要都是在用這顆HDD，因此當時BIOS就認定這顆是主硬碟，
而最近購入SSD之後就把OS裝在SSD上面，直接把HDD這顆硬碟做為資料碟。

這樣的狀態下在開機後還是可以選擇要進入新/舊的OS，
不知道是不是因為SSD跟HDD先後安裝OS、且有雙系統狀態的關係，
造成目前無法從BIOS中調整SSD為主要硬碟的關係呢?

(把SSD設定為主硬碟，電腦會卡在叫我選擇正確的裝置開機，且無法看到WINDOWS畫面)

GOOGLE有爬到SSD+HDD配置的相關文章，有人提到要把SSD裝在SATA0的線路上才能設定為
主硬碟，還是說這才是正確的做法呢? 謝謝。

PS:目前我的兩個SATA線都是裝在硬碟上，但是沒有從SATA0開始插起，是插在1跟2。

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│OS ：Win 8.1 64bit企業││HDD：創見SSD340 128+WD 1T ││電視卡M5F │
│CPU：Intel i5-750 2.6G││VGA：XFX GTX260 黑盒 ││先鋒DVD光碟機 │
│MB ：ASUS P7P55D ││PSU：Antec 550w ││先鋒BD-RW S08XLT│
│RAM：創見 12G 雙通道 ││LED：LG E2750 ││ESATA外接 WD1.5T│
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