CentOS fortran平行計算問題 - Linux

Susan avatar
By Susan
at 2022-03-23T22:27

Table of Contents

https://www.slothparadise.com/running-mpi-common-mpi-troubleshooting-problems/


https://i.imgur.com/pKWdhds.jpg

也遇到這個網站貼一個問題
已經照他的建議操作
但是還是有一樣的error
我懷疑是library沒辦法在各個nodes 共用

想請問有人有類似經驗 很需要幫忙 謝謝
可以再私訊詳述問題 麻煩了

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Tags: Linux

All Comments

Joseph avatar
By Joseph
at 2022-03-22T18:49
總共有6個nodes 但是只能利用其中一個 也就是指令只能
是#PBS -l nodes=1:ppn=40 最多
Mia avatar
By Mia
at 2022-03-26T10:56
每個節點彼此都要能免密碼登入，這點確定了嗎?
Adele avatar
By Adele
at 2022-03-22T18:49
有的 感謝提醒 還有什麼要注意的嗎
Anonymous avatar
By Anonymous
at 2022-03-26T10:56
每個節點防火牆、selinux都關掉，可以輸出PBS的log
Zenobia avatar
By Zenobia
at 2022-03-22T18:49
可以試試看在每個節點跑mpirun確認是不是submit問題
Ursula avatar
By Ursula
at 2022-03-26T10:56
再來把.ssh/known_hosts節點清掉排除hosts key問題
Adele avatar
By Adele
at 2022-03-22T18:49
沒有 InfiniBand 多節點也只是無用的技術。
Margaret avatar
By Margaret
at 2022-03-26T10:56
跨節點建議 /home 及 /opt 用 NFS 分享，ssh key放/home
Iris avatar
By Iris
at 2022-03-22T18:49
另外建議用 PIC 編譯所有的程式碼。
John avatar
By John
at 2022-03-26T10:56
因為 PIC 會影響分支預測的準確率。
Ivy avatar
By Ivy
at 2022-03-22T18:49
一般建立mpi時，會用nis在每個節點建立相同的使用者
代號。若要用ssh方式，要使用ssh_keygen做出金鑰對放
到各節點
Mason avatar
By Mason
at 2022-03-26T10:56
其實nis+nfs共享home就不用每個節點丟key了
放到head node自己的auth key就每個節點通用
不然很多台每個使用者每台都要做一次真的累
Audriana avatar
By Audriana
at 2022-03-22T18:49
但就是平行時比較吃網路

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George avatar
By George
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