CentOS fortran平行計算問題 - Linux

Susan · 2022-03-23

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也遇到這個網站貼一個問題
已經照他的建議操作
但是還是有一樣的error
我懷疑是library沒辦法在各個nodes 共用

想請問有人有類似經驗很需要幫忙謝謝
可以再私訊詳述問題麻煩了

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All Comments

Joseph2022-03-22

總共有6個nodes 但是只能利用其中一個也就是指令只能
是#PBS -l nodes=1:ppn=40 最多

Mia2022-03-26

每個節點彼此都要能免密碼登入，這點確定了嗎?

Adele2022-03-22

有的感謝提醒還有什麼要注意的嗎

Anonymous2022-03-26

每個節點防火牆、selinux都關掉，可以輸出PBS的log

Zenobia2022-03-22

可以試試看在每個節點跑mpirun確認是不是submit問題

Ursula2022-03-26

再來把.ssh/known_hosts節點清掉排除hosts key問題

Adele2022-03-22

沒有 InfiniBand 多節點也只是無用的技術。

Margaret2022-03-26

跨節點建議 /home 及 /opt 用 NFS 分享，ssh key放/home

Iris2022-03-22

另外建議用 PIC 編譯所有的程式碼。

John2022-03-26

因為 PIC 會影響分支預測的準確率。

Ivy2022-03-22

一般建立mpi時，會用nis在每個節點建立相同的使用者
代號。若要用ssh方式，要使用ssh_keygen做出金鑰對放
到各節點

Mason2022-03-26

其實nis+nfs共享home就不用每個節點丟key了
放到head node自己的auth key就每個節點通用
不然很多台每個使用者每台都要做一次真的累

Audriana2022-03-22

但就是平行時比較吃網路