Re: qsub 如何指定node - Linux
By Agatha
at 2013-01-27T12:44
at 2013-01-27T12:44
Table of Contents
※ 引述《pipidog (如果狗狗飛上天)》之銘言:
: 如題,要把job送到cluster上,但是cluster上有某幾個node很不穩,
: 想要避開那些node. 知道指定node的命令式
: qsub -q xxxxx abc.sh
: 其中那個xxxxx是node的名字,但是這裡我想要的是,指定一堆可以
: 使用的node,讓系統自己從這些node裡面挑出一個. 而不是指定單
: 一的node. 請問該怎麼做呢?
幫你GOOGLE了一下
先看原廠的說法
http://www.pbsworks.com/yaf_pbs/default.aspx?g=posts&t=139
1) configure custom resources on each of the MOMs
resources_available.appname=4 ( in case of quad core machine)
resources_available.appname=0 ( in case of that particular node that job
should not be scheduled).
2) Stop the PBS MOM service on that node
3) Make that node offline
4) qsub -l nodes=hostname1+hostname2+hostname3 (skip the host name for not
scheduling job on to that node)
看來123都要admin才作得到
你只剩下四 就是指定node去run
另外還看到一種說法 滿XD的
http://moss.csc.ncsu.edu/~mueller/cluster/arc/faq.html
Run an empty job that keeps the bad node busy, then start you real job.
echo sleep 600 | qsub -l host=compute-0-100,walltime=1000
用empty job去占用那些不好的node (給老子睡覺去 你們這些bad nodes)
所以...你考慮看看XD
認真說...你還是通知一下admin看看怎麼改善那些node才是上策 Orz
--
: 如題,要把job送到cluster上,但是cluster上有某幾個node很不穩,
: 想要避開那些node. 知道指定node的命令式
: qsub -q xxxxx abc.sh
: 其中那個xxxxx是node的名字,但是這裡我想要的是,指定一堆可以
: 使用的node,讓系統自己從這些node裡面挑出一個. 而不是指定單
: 一的node. 請問該怎麼做呢?
幫你GOOGLE了一下
先看原廠的說法
http://www.pbsworks.com/yaf_pbs/default.aspx?g=posts&t=139
1) configure custom resources on each of the MOMs
resources_available.appname=4 ( in case of quad core machine)
resources_available.appname=0 ( in case of that particular node that job
should not be scheduled).
2) Stop the PBS MOM service on that node
3) Make that node offline
4) qsub -l nodes=hostname1+hostname2+hostname3 (skip the host name for not
scheduling job on to that node)
看來123都要admin才作得到
你只剩下四 就是指定node去run
另外還看到一種說法 滿XD的
http://moss.csc.ncsu.edu/~mueller/cluster/arc/faq.html
Run an empty job that keeps the bad node busy, then start you real job.
echo sleep 600 | qsub -l host=compute-0-100,walltime=1000
用empty job去占用那些不好的node (給老子睡覺去 你們這些bad nodes)
所以...你考慮看看XD
認真說...你還是通知一下admin看看怎麼改善那些node才是上策 Orz
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